Da die Schüssler Salze frei von Nebenwirkungen und es nicht zu Wechselwirkungen mit anderem Medikamente kommen kann, eignen sich diese in Tablettenform besonders für Kinder. Die Anwendungsgebiete sind die gleichen wie bei Erwachsenen. Selbst Babys, die gestillt werden, können bereits Schüssler Salze über die Muttermilch einnehmen. Bei Flaschenkindern wird das Salz in die heiße Milch eingerührt und aufgelöst.

Die Laktosebasis der Tabletten schmeckt angenehm süß, weshalb Kinder die Tabletten sehr gerne lutschen. Außerdem ist aufgrund der natürlichen Basis eine schädliche Überdosierung kaum möglich, falls doch Komplikationen eintreten sollten, ist unbedingt Rat bei einem Arzt einzuholen. In jedem Fall sollten Behandlungen von Kindern mit Schüssler Salzen nur nach Rücksprache mit einem Arzt oder Heilpraktiker und bei genau bekannten Erkrankungen durchgeführt werden.

Die Anwendung der Schüssler Salze gestaltet sich bei Babys und Kleinkindern zudem etwas schwierig. Anders als Erwachsene sind Kinder in diesem Alter noch nicht in der Lage, die Tabletten im Mund zergehen zu lassen. Es empfiehlt sich deshalb, die Tabletten in heißem Wasser aufzulösen, das Getränk etwas abkühlen zu lassen und den Kindern dann zu verabreichen. Wenn möglich sollte in kleinen Schlücken getrunken werden, damit der Körper die Wirkstoffe gut über die Schleimhäute aufnehmen kann. Hier muss allerdings genau auf die passende Dosierung geachtet werden. Diese sollte etwa ¼ der Menge für Erwachsene betragen.

Bei Laktoseunverträglichkeit gibt es so genannte Globuli, die zwar nicht zur herkömmlichen Schüssler Salz Therapie gehören, aber auch von Heilpraktikern verschrieben werden.